此地為一典型的河口生態系，水筆仔攔截淡水河挾帶之大量泥沙及有機物，形成一片沼澤地。但由於河水受到污染，且有許多業者於該區附近採砂，致使具有國土保安功能的紅樹林生存受到威脅。為了保存紅樹林及其伴生動、植物所形成的生態系，避免受到人為干擾，農委會於民國83年1月，將該區公告為「挖子尾自然保留區」。

本區位於台北縣八里鄉淡水河口南岸，緊臨觀音山地，周圍有大屯山系和觀音山系形成天然屏障。

挖子尾的動物有鳥類、蟹類、貝類及魚類等。貝類有文蛤、燒酒螺、孔雀蛤、牡蠣、玉黍螺、藤壺﹔魚類方面有彈塗魚及花跳等。鳥類約100多種，以候鳥為主，其中以唐白鷺在本區之出現，最值得重視，這是一種由國際自然保育聯盟 (IUCN) 所認定之瀕臨滅絕種。近五年來，由於當地環境改變，唐白鷺和其他種鳥類之出現情形，有減少之趨勢。