Entre o claustro e a porta lateral que permite a entrada de quem vem da rua do Souto havia ainda outra zona, encostada à parede lateral norte da capela dos Reis, que era conhecida como claustro Santo Amaro. Há quem aqui tenha localizado um claustro no período gótico, mas há duvidas que tal tenha acontecido. No século XVIII havia aqui uma serie de arcos que separavam três capelas, as de Santo Amaro, Nossa Senhora da Boa Memória e Santíssima Trindade. Com o restauro dos Monumentos Nacionais estas capelas passaram para outro local, para a capela de Nossa Senhora da Piedade, criando-se um arco medieval interrompido, de forma a parecer ter ali existido uma estrutura em arcos. Era aqui que se localizava o principal cemitério da cidade, onde por exemplo foi sepultado o Mestre André Soares, grande vulto da arquitectura/escultura rocócó portuguesa e de quem existem obras, dois retábulos, nesta mesma catedral.

Este espaço serve também como exposição de peças antigas em pedra, das quais a mais concorrida é a do velho pelourinho quinhentista da cidade.