Uma capela funerária de origem visigótica, um raro monumento pré-romanico em Portugal. Segue o modelo de Gala Placídia de Ravena. Por volta de 656 São Frutuoso, Bispo de Bracara, funda neste local o Mosteiro de São Salvador, mandando construir a capela para seu tumulo. Quando ele morreu em 665 fica aqui sepultado. Na Igreja de S.Francisco, conservam-se as relíquias de S.Frutuoso, levadas para Santiago de Compostela em 1102 durante a incursão do Arcebispo de Compostela D.Guelmirez  e devolvidas apenas em 1966. Em 1523 o Arcebispo de Braga, D.Diogo de Sousa funda aqui o Convento Franciscano dos Capuchos da Piedade destruindo provavelmente o anterior Mosteiro de S.Salvador. Em 1728 por ordem do Arcebispo D. Rodrigo de Moura Teles, dá-se início à reconstrução e remodelação da igreja do convento de São Francisco, sendo a Capela de São Frutuoso integrada na igreja e passando a ter acesso principal através do interior desta; é destruida a fachada principal, os baldaquinos internos e respectivas colunas, e são modificados os braços Este e Norte. As dependências conventuais ficam para nascente da capela de S.Frutuoso e  formam um U.