博物馆由清华大学建筑工程研究设计院设计，并聘请世界著名贝类专家、日本东京软体动物研究所所长小菅贞男先生为贝壳博物馆的指导顾问。
博物馆的大部分展品来自于著名贝壳收藏家张毅先生长达30年的个人收藏。张毅先生30年不懈努力，在收藏各类珍稀贝壳的同时，还编辑、整理出了《世界贝壳原色图鉴》，为填补
我国贝类文化研究方面的空白、传播贝类相关文化方面做出了巨大的贡献。