提督署背山面海，坐北朝南，围以长垣，占地1万平方米，是一座砖木结构的古建筑群。沿中轴线有三进院落，分前、中、 后三厅。前为议事厅，中是宴会厅，祭把厅在后面。东西跨院问有长廊贯通。

大门前左右角楼为鸣金、奏乐和了望处，东西两侧是辕门。整个建筑飞檐画栋，雄伟壮观。

提督衙门外西南200米处是水师提督丁汝昌的寓所。清光绪二十年（1894年）甲午海战中，北洋水师与日寇激战于黄海。提督丁汝昌和舰长邓世昌英勇奋战，最后壮烈殉国。

提督署现辟为中国甲午战争博物馆，由中共中央总书记、国家主席江泽民同志题写馆名。该博物馆还负责管理和保护龙王庙、水师学堂、北洋海军将士纪念馆等28处北洋海军旧址。